Hallo,
wenn Du diese Sicherungen durchführst, dann machst Du zwei grundverschiedene Sicherungen.
Zum einen wie Du schon sagtest, die komplette Datenbank inclusive Transaktionsprotokolle werden gesichert und die nicht mehr benötigten Transaktionsprotokolle gelöscht.
Das zweite ist ein sog. Bricklevel Backup.
Da kannst Du die Postfächer einzeln sichern. Wobei Du bei einer Onlinesicherung seit Exchange 2003 die ganze Datenbank in die RSG sichern kannst und dann mittels Exmerge die Inhalte der Postfächer verschieben kannst.
Aber Da du soweit ich mich erinnere, Exchange 2000 einsetzt und da auch nicht den allerneuesten Patch für die Store.exe hast, würde ich Dir den neuesten Patch zukommen lassen. Wenn Du einen FTP Share hast, lass es mich wissen.